С 15 сентября 1941 года по 15 апреля 1942 года был курсантом 5 учебного батальона 5 учебной бригады в городе Кургантобе Таджикской ССР. В апреле 1942 года был направлен на фронт. С апреля 1942 года по январь 1943 года командовал расчетом 391 полка 61 строевой дивизии. Участвовал в освобождении Польши, Чехословакии. Был демобилизован в декабре 1946 года. Принимая непосредственное участие в боях с немецкими захватчиками, был дважды ранен. За образцовое выполнение боевых заданий и проявленные при этом доблесть и мужество был награжден правительственными наградами: "За отвагу", " За боевые заслуги", "За победу над Германией", орденом Великой Отечественной войны 1 степени и другими юбилейными медалями. Манапа Амитова все звали Будённым, потому что и внешне, и бравой выправкой он походил на легендарного военачальника. К тому же, он был разведчиком и часто ходил в тыл врага. Он славился тем, что без "языка" не возвращался. После безупречного выполнения очередного задания командир направил в высшее командование представление о присвоении Амитову Манапу звания Героя Советского Союза. В этот период он после ранения находился в госпитале. А когда вернулся в расположение, узнал о том, что его часть разгромили фашисты. Приказ о награждении был утерян.
Всю оставшуюся жизнь посвятил милиции, дослужился до подполковника и в 1985 году вышел на пенсию.
