Яков Васильевич Клишин родился в 1908 году в селе Дегерес Джамбульского района Алматинской области в русской крестьянской семье. После окончания начальной школы работал в колхозе. С 1941 года работал на судоверфи в Аральске. В 1942 году был призван на службу в армию.
В 1944 году ефрейтор Клишин являлся сапером 169-го саперного батальона 137-ой стрелковой дивизии, 48 армии Белорусского фронта. 22 января 1944 года в составе взвода в наступательном бою в районе деревни Заклетное переправил пушки стрелкового полка через трудно проходимое болото протяженностью 1,5 км и перенес 30 ящиков со снарядами, за что 2 февраля был удостоен ордена Славы 3 степени.
10 октября 1944 года Клишин в составе того же батальона под огнем переправился через реку Нарев в районе населенного пункта Плевица и, проделав проход в заграждениях, в числе первых достиг вражеской траншеи, за что 27 декабря получил орден Славы 2 степени. В бою 16 февраля 1945 года в районе населенного пункта Грос-Раутенберг, обеспечивая действия самоходного артиллерийского полка, обезвредил 30 противотанковых мин противника, из автомата уничтожил свыше 10 солдат. 16 марта 1945 года в бою за город Тигенхоф проделал проход в минном поле для САУ, за что 29 июня 1945 года был награжден орденом Славы 1 степени. В 1945 году демобилизовался. Вернулся в родное село Дегерес, где стал работать плотником. Умер в 1956 году.
